Desinstalando o Zimbra da forma correta
Quando instalado, o Zimbra altera várias estruturas do sistema. Sendo assim, somente apagar as pastas do Zimbra não desinstalará o mesmo.
Para que a desinstalação ocorra completamente, basta seguir o seguinte passo.
Dentro da pasta de extração, executar:
# ./install.sh -u
Fonte: http://www.vivaolinux.com.br/dica/Desinstalando-o-Zimbra-da-forma-correta